研究表明，饲料发酵技术能有效降解饲料中的抗营养因子，促进养分的消化吸收，改善动物健康，减少饲用抗生素(促生长)的使用。选取合适的微生物进行饲料的发酵能有效降解饲料中的抗营养因子，促进养分的消化吸收，分泌的代谢产物如小肽，有机酸等利于改善动物健康。

近年来，随着饲用抗生素使用的逐步受限，无抗养殖势在必行，如何保障畜禽健康减少药物依赖成为我国畜牧业的一大挑战。常规的饲料原料中，玉米和豆粕是养殖中最常用的原料，而豆粕中的抗原蛋白、胰蛋白酶抑制剂及植酸等抗营养因子会阻碍消化道吸收利用营养物质，不利于动物生长和健康。

目前乳酸菌、酵母菌、枯草芽孢杆菌被广泛引用于饲料发酵。其中，乳酸菌产生的有机酸、细菌素等代谢产物有利于改善饲料的营养品质，酵母菌能降解豆粕中的水苏糖、棉子糖，而枯草芽孢杆菌对豆粕中抗原蛋白具有较强的降解效果。多菌株混合发酵理论上可以发挥不同菌株的发酵特性，但是不同菌株间存在可能存在拮抗作用，比如，当米曲霉和干酪乳杆菌直接混合发酵豆粕，会降低米曲霉对豆粕中抗原蛋白的降解效果。而采用菌酶协同发酵，可以提高发酵过程中微生物对饲料中大分子物质利用效率，如纤维素酶水解秸杆生成的单糖能为酵母菌合成菌体蛋白提供能量，进而提高饲料品质。

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